Punase värvi maksimeerimiseks saame mõjutada ja manipuleerida mõningaid, kuid mitte kõiki neid tegureid. Õunanahas on kolm pigmentide rühma ja kõigi kolme pigmendi kontsentratsioonid muutuvad hooaja jooksul. Klorofüllid on rohelised pigmendid, mis vastutavad fotosünteesi eest ja asuvad rakus kloroplastides. Karotenoidid on kollased, oranžid või punased ning paiknevad rakkudes kromoplastides. Antotsüaniinid on punased, sinised või lillad ning paiknevad raku vakuoolides. Õunte küpsedes laguneb klorofüll ja kloroplastide üleminekul kromoplastideks karotenoidide hulk suureneb. Samal ajal võib antotsüaniinide tase suureneda kuni 5 korda. Õunanahas on kahte tüüpi rakke: epidermis on 2 või 3 raku sügavus ja epidermise all on 6–10 hüpodermise rakku. Naha punetus sõltub nende antotsüaniini sisaldavate rakkude osakaalust.
Veel antotsüaniinidest
Antotsüaniinid on vees lahustuvad ja seetõttu pleegituvad need keetmisel. Seevastu paprika ja tomati punased pigmendid on karotenoidid ja jäävad keetmisel punaseks, kuna need ei lahustu vees. Antotsüaniinid kuuluvad lõhnatute molekulide klassi, mida nimetatakse flavonoidideks ja maitsevad mõõdukalt kokkutõmbavalt. Antotsüaniinid on antioksüdandid ja võivad kaitsta taimekudesid UV-kiirguse ja kõrgete temperatuuride eest. Antotsüaniinid on glükosiidid, mis on suhkrumolekule sisaldavad orgaanilised molekulid ja kuuest tavalisest glükosiidist on kõige levinum tsüanidiin-3-galaktosiid. Nende glükosiidide värvus võib varieeruda oranžist siniseni kuni lillani. Nende glükosiidide värvus võib muutuda, kui rakulahuse pH-d muudetakse; kõrge pH korral on värvus sinine ja madala pH korral punane. Kui virsikud puutuvad kokku kõrge pH-ga veega, tekivad nahale triibud või tint sageli tumesinine või peaaegu must.
Antotsüaniini biosünteesi rada on üsna hästi mõistetav. Antotsüaniini eelkäija on aminohape fenüülalaniin ja antotsüaniini sünteesimiseks fenüülalaniinist on vaja seitset biokeemilist etappi. Hiljutised uuringud on näidanud, et antotsüaniini sünteesi õunakoores ja -lihas kontrollib geenide perekond. Protsessi iga etappi katalüüsib erinev ensüüm ja kõiki neid ensüüme kontrollib üks või kaks kolmest geenist. Protsessi esimesest kuuest etapist kolmes juhitakse geene valguse ja kolme etapi puhul nii valguse kui ka temperatuuriga, kuid viimases etapis osalevat geeni juhib peamiselt temperatuur. Apple'il on 17 kromosoomikomplekti ja seni on nahavärvi geenid tuvastatud kromosoomidel 2 ja 9.
Honeycrispi kohta on tehtud üsna palju uuringuid, et teada saada, miks mõned õunad on triibulised, teised aga õhetavad. Mõnikord annab terve puu kas triibulisi või õhetavaid vilju, kuid mõnikord leidub mõlemat tüüpi samal puul ja isegi ühes kobaras. Minnesotas tehtud uuringud on näidanud, et triibulistel nahapiirkondadel on suurem aktiivsus kahel kolmest geenist, mis vastutavad punase värvuse eest.
Puu toitumine
Mõned kasvatajad arvavad, et nad võivad parandada punase värvuse arengut, parandades puu toiteväärtust, kuid enamikul anorgaanilistel elementidel on vähe mõju värvile, eriti kui temperatuur ja valgus ei sobi värvi arendamiseks. Hilishooaja kõrge lämmastikusisaldus põhjustab fenüülalaniini muundumise pigem valkudeks kui antotsüaniiniks, seega tuleks vältida kõrget hilishooaja lämmastikusisaldust. Värvuse heaks arenguks on vaja piisavat kaaliumisisaldust. Nii et kui puudel on kaaliumipuudus, võib kaaliumi kasutamine värvide arengut parandada. Kui toiteväärtus on piisav puude hea kasvu ja vilja saamiseks, siis tõenäoliselt ei paranda mis tahes elemendi lisamine värvide arengut.Tarbetu kaaliumi või magneesiumi kasutamine põhjustab tõenäoliselt pigem kibedat süvendit kui punast värvi.
Kokkuvõtteks võib öelda, et kui soovitakse väga värvilisi vilju, on oluline istutada kultivarid ja tüved, mis on geneetiliselt programmeeritud tootma väga värvilisi vilju. Peale sobivate kultivaride valimise on kasvatajatel ainult mõõdukas võime soodustada punase värvuse arengut. Kui temperatuur on punase värvuse arendamiseks piisav, soodustab puude pügamine ja treenimine, et võimaldada hea valguse läbitungimist kogu võras, maksimaalset värvide arengut. Puudele avaldatava stressi, eriti üleharimise, põua, ebatervisliku lehestiku ja toitainete puudujääkide vältimine on oluline, kuid see ei kompenseeri kõrgeid temperatuure ega vähese valguse taset.
